我国著名的历史学家陈垣，在长期的学术研究和教学工作中，贯穿着强烈的爱国主义思想。青年时期，他就怀有救国救民之志，积极参加爱国活动，宣传爱国思想。

　　早在1921年，陈垣就在一次集会上说：“现在中外学者谈汉学，不是说巴黎如何，就是说东京如何，没有提中国的。我们应当把汉学中心夺回中国，夺回北京！”他对于“史在他邦，文在海外”的状况极为不满，他深以中国史学不发达为憾，常说日本史学家寄一本新著作来，无异一炮打到我的书桌上。认为这是国家的耻辱，因而主张：“在自己的岗位上，把工作做好，要超过别人，超过外国。”

　　1924年，北京文化界的爱国人士，为奋力阻止敦煌珍贵文献被继续劫掠外流，组织了“敦煌经籍辑存会”，从事搜集整理工作。这期间，陈垣在助手帮助下，花了3个月的时间，将北平图书馆珍藏的敦煌经卷8000余轴分辨类别、考订同异、编成目录，名为“敦煌劫余录”。

　　“劫余”二字，表示历次遭劫仅存之意。有人当时建议，是不是可以用词缓和一点，“劫余”二字过于刺激了。但是他说不行，“劫余”二字还不能抒发他的愤慨之情，所以坚持不改。出版的时候，陈垣先生在序言里还点名批评了掠夺敦煌文物的伯希和：“(清光绪)三十三年，匈人斯坦因、法人伯希和相继至敦煌，载遗书遗器而西，国人始大骇悟。”可见，他对维护中华民族历史文化的尊严，是何等坚毅。

　　七七事变爆发后，北平被日军侵占。他身处危境，闭门研究，坚决不与日本人合作，坚决与敌斗争。在大学讲坛上，他讲抗清不仕的顾炎武《日知录》，讲表彰抗清民族英雄的全祖望《鲒埼亭集》，以此自励，亦以此勉励学生爱国。同时，他还利用史学研究作为武器，连续发表史学论著，抨击敌伪汉奸，显示不屈不挠的民族气节。